稻妻地区的地下室谜题主要围绕雷元素机关展开，其中荒海、蛇神之首等区域的地下室解谜流程较为复杂。荒海地下室需先点亮四个雷机关柱子，启动机关后跳入井中，使用留念镜观察三个小狐狸神像并激活出现的机关，随后携带雷种子穿过屏障。雷元素攻击大狐狸雕像可获得镇物，将其按特定顺序放置于鸟居结界内，其中两处需用镜子照射后才能解锁，最终完成祝祷并击败出现的敌人即可解开谜题。
蛇神之首地下室解谜涉及多层机关联动。地面雷神瞳上方第一道门需追逐两个雷灵至蛇首正上方激活，雷灵会隐藏于草丛或蛇首顶部。进入地下后，第二层右侧开关需搜查后开启铁门，随后通过特定顺序踩踏地板机关。部分解谜需观察蛇骨密室内石板图案，按逆时针方向调整五盏雷灯的序列，使所有石块亮起的纹路数量一致。若解谜失败，退出游戏重新登录可重置机关状态。
清籁旧宝任务中的地下室采用三重地板谜题设计。首层需按藏宝图字符顺序踩动三块印有符号的地板，进入地下室后需完成一笔画式点亮所有地板的挑战。具体操作为：从起始点出发，按照T→ω→よ的路径连续踩踏，确保每块地板仅触发一次且全部亮起。第二次机关变化后，需重新启动开关并按新图案顺序踩踏，最终击败盗宝团、野伏众和愚人众三类敌人方可获取宝箱。
神樱大祓任务获得的留念镜可照射地狐像，显现隐藏的机关或结界。绀田村井底解谜需调整五个雷灯的数量，使其与中间图案显示的序列对应，逆时针方向标记为1至5号位，祝祷灯固定为1号不可调整，其余按图案指示递增点亮。雷种子树和电气水晶常作为传导介质，需合理利用角色元素战技建立电流通路。
稻妻地下室普遍存在复合型机关设计，如雷立方、雷霆探针与放电石的组合解谜。雷立方机关需攻击使其特殊花瓣面朝向统一方向，相邻立方会产生联动旋转。雷霆探针需角色处于雷元素附着状态，使指针指向基座标明的正确方位。放电石、继电石和聚电石构成的电流网络，要求玩家移动继电石或利用雷元素角色传导，确保电流从放电石直达聚电石。这类机关复位机制较强，离开过远或登录重置均会恢复初始状态。
部分屏障需雷种子达到特定等级才能穿透，妖狸伪装的物体被攻击后会掉落圣遗物或触发机关。雷灵座可作为临时导电体，跟随雷灵至终点可激活隐藏机关。若遇到无法推进的谜题，可检查周边是否遗漏雷神瞳、未照射的地狐像或未触发的雷灵。多数地下室谜题遵循观察图案-激活载体-调整序列的逻辑链条，系统性排查各环节通常能发现破解关键。
