地牢宝箱主要分为两大类：黄金宝箱和环境宝箱。黄金宝箱需要黄金钥匙开启，钥匙可通过地牢怪物掉落或从宝箱、罐子中随机获取，其中地牢史莱姆100%掉落黄金钥匙。黄金宝箱内包含肉山前的武器和杂物，如妖刀村正和钴盾，这些物品具有较高的合成潜力。环境宝箱则需在肉山后通过特定钥匙开启，每种环境宝箱对应一种生物群系，内含接近毕业级别的强力武器，如吸血飞刀、腐化灾兵等。
环境宝箱的开启钥匙需通过合成获得，材料包括机械三王的魂（视野之魂、力量之魂、恐惧之魂各5个）、世纪之花掉落的神庙钥匙，以及对应生物群系的模具。模具的掉落率为1/4000，仅与怪物死亡时所处的环境相关，人工制造的环境（如堆积黑檀石形成的腐化生态）也可触发掉落。雕像生成的怪物或陨石怪不会掉落模具。
地牢环境宝箱包含五种核心类型：神圣宝箱（彩虹枪）、丛林宝箱（食人鱼枪）、冰雪宝箱（冰霜九头龙杖）、腐化宝箱（腐化灾兵）和血腥宝箱（吸血飞刀）。这些武器各具特色，例如吸血飞刀具备远程吸血效果，腐化灾兵可分裂小吞噬者造成范围伤害，而彩虹枪则以持续光束攻击见长。武器强度与适用场景差异明显，需根据战斗需求选择。
黄金宝箱在肉山前即可开启，但环境宝箱必须击败肉山并进入困难模式。地牢结构复杂且怪物强度较高，建议配备抗暗影buff装备或照明道具以提高生存率。开启宝箱后，钥匙会被消耗，但宝箱本身可重复使用。若遇到门被装饰物阻挡的情况，可用镐子破坏门体解决。
